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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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3940 个回答

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请问老师怎么获得这个gff3_file_to_proteins.pl脚本来着?

这个脚本在我们的docker基因家族镜像里面你拷贝出来就行:https://www.omicsclass.com/article/2307

回答于 2024-01-25 09:23

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VCF文件

检查VCF文件是不是有问题吧,或者你这个是不是GVCF呢;

回答于 2024-01-25 09:22

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cytoscape替换ID报错

设置key列与网络里面的node ID不一致吧,你检查数据

回答于 2024-01-25 09:21

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使用了pop-evol-gwas2.0,还是报错,但是我安装的时候这个2.0特别...

课程资料也相应更新了:https://www.omicsclass.com/article/2286,所以你的脚本也需要重新下载更新才行;不然你还是用之前版本的镜像,v1.2  因为latest现在就是2.0 所以很快下载完成;

回答于 2024-01-23 16:16

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老师请问这个比较基因组课程里串联法构建进化树,脚本里面的构树...

1.50次这个只是ML法的算法,随机50个树出来不断迭代找到最优树,和你构树次数没关系; 2.没有测试过哪个快,个人感觉并联法会快, 最终快慢和你的基因数量有关;越多越慢

回答于 2024-01-23 16:13

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为什么做gwas分析的时候,经过性状数据分析的步骤后,输出的文件...

删除了一些离群值的样本,这是软件自动处理的,你也可以选择不用,使用另外的没有处理的文件;

回答于 2024-01-23 16:08

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GeMoMa报错

GFF格式不标准吧;信息太少不好回答你的问题; 不建议NCBI上的基因组分析,格式不标准很可能导致报错;

回答于 2024-01-22 11:04

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用Docker进行单细胞测序数据合并时,执行合并代码时候,报错。

有文件路径写错了吧,你检查检查的;

回答于 2024-01-22 11:00

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获得初步基因家族基因列表出错

做了evalue过滤数量不同正常的;

回答于 2024-01-22 10:59

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老师您好,我做顺式元件分析结果做出来的图无论是TBtools还是课...

看上去不正常,你输入文件看看起始终止位置是不是写错了;

回答于 2024-01-22 10:59