omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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基因组注释

课程里面有讲的，你看看的：https://bdtcd.xetslk.com/s/3QzQFb

回答于 2024-01-16 16:22

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一个基因不能算作一个家族；至少两个基因以上才算；

回答于 2024-01-15 21:15

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1.图中的-L参数，如果有20条染色体，就需要设置为-L1 -L2...-L20吗对的，或者用一个文件，一行一个染色体； 2.qeseq脚本中的-t 线程数和-Xmx内存数如何设置能最大利用资源，例如在超算上选择48核心有336G内存，怎么设置好呢？ GATK普通版本多线程不支持；

回答于 2024-01-15 21:14

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这里都是重复的ID，你检查对比例子文件，看看文件是不是搞错了：

回答于 2024-01-15 09:39

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1.检测模型的power不够，可以换blink farmCPU重新分析试试 2.位点本身由微效位点控制，样本数量不够检测效能不够，可以增加样本量 3.样本没有群体结构矫正过头，可以去除群体结构矫正

回答于 2024-01-14 21:00

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看看46行有没有异常：检查是否有单引号或者双引号，如果有可能导致R读取报错；

回答于 2024-01-14 20:57

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循环可以的；每个文件夹里面只有一对fastq文件吗，不然可能会有可能报错；

回答于 2024-01-14 20:56

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CNV做不了这些分析的；硬要做需要做格式转换；

回答于 2024-01-14 20:54

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简单的话你可以运行两次这个命令，依次去除；或者可以这样 --p-front-f ATCCC ATCG 多个引物后面空格隔开贴一下，这个没有测试，不知道行不行，你可以试一下；

回答于 2024-01-14 20:52

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输入文件格式问题，需要查看代码测试才可以找到原因；

回答于 2024-01-11 11:42