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vcftools --vcf GT_AGCT_Liujingyan.vcf --max-missing 0.5 --ma...
vcftools 没有这个功能，你可以看看他的帮助：https://vcftools.sourceforge.net/man_latest.html
回答于 2024-01-03 11:14
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Gemma做GWAS的时候，用Gemma自带的文件运行时， mv ./output/kin...
看看文件路径是否正确吧，你检查路径：./output/kin.sXX.txt
回答于 2024-01-03 10:45
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Gemma做GWAS的时候，用Gemma自带的文件运行时， mv ./output/kin...
看看文件路径是否正确吧，你检查路径：./output/kin.sXX.txt
回答于 2024-01-03 10:45
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老师，如果基因家族鉴定出来只有几个，按照HKT那个文献说的也要...
不同物种搜索鉴定的时候可以分开进行， 最后绘图展示可以合并一起，比如进化树，不同的序列可以直接cat一起即可就可以做进化树了； 镜像随便用反复用都可以，有hmm模型可以不用blast鉴定；
回答于 2024-01-03 10:44
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CombineGVCFs报错：htsjdk.samtools.SAMFormatException: Did no...
这个报错没遇到过，新版的GATK不推荐用这个方法了，用：GenomicsDBImport 导入数据库，再 GenotypeGVCFs 具体可以看课程：https://bdtcd.xetslk.com/s/1VQOjQ
回答于 2024-01-03 10:40
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sqlite数据库 配置
sqlite数据库不需要任何配置，我们的镜像已经配置好了，直接使用即可, 不需要link docker run -it --rm --name annotation -v /home/super/Desktop/:/work omicsclass/genome-annotation
回答于 2024-01-02 10:57
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使用wget下载隐马可夫下载不了，并且也不能通过xftp传输，传输时...
建议用filezilla 上传下载文件：https://www.omicsclass.com/article/560
回答于 2024-01-02 10:49