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擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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4032 个回答

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老师，我现在在学习泛基因组分析，研究物种是梨；现已找到13个基...

泛基因集的构建也选这13个

回答于 2025-02-08 08:57

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老师你好，我想问一下，我做基因家族分析，明明之前建了02.hmmse...

上面报错了，没有 出结果，你检查输入输出文件路径是不是写错了；

回答于 2025-02-07 09:31

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treemix

你的染色体数量有多少，例如可以加个参数设置一下：--chr-set 38

回答于 2025-02-05 09:30

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老师，请问在做结构变异分析的时候找到了与VCF文件相似的多个EXC...

vcf文件是文本文件，建议你从excel文件复制出来贴到文本文件里面，保存文件名字后缀.vcf

回答于 2025-02-05 09:25

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老师，我想问一下，我正在学泛基因家族分析；自己的数据如何上传...

都可以的，如果是压缩包上传之后解压一下即可；

回答于 2025-02-05 09:24

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xpclr计算

自己手动建立一下vcf文件的索引： tabix -p vcf file.vcf.gz

回答于 2025-01-23 17:50

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xpclr绘图

基因少，你自己用adobe illustrater 软件手动编辑PDF文件标注；

回答于 2025-01-21 10:12

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dadi

建库用的参考基因组，和vcf里面的参考基因组不一致，你检查检查，要用同一套基因组，版本也有相同；

回答于 2025-01-21 10:11

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通过GWAS分析找到显著snp后，对这个snp进行单倍型分析，把群体分...

不知道你用什么方法检验的，没有显著性，可以换成 Wilcox秩次检验试试；

回答于 2025-01-21 10:09

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请问跟着教程做的时候，无法下载omicsclass/reseq:v1.1，老师您...

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回答于 2025-01-21 09:53