omicsgene
omicsgene - 生物信息
实名认证 专业认证

性别: 北京 - 北京市 注册于 2018-04-20

擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

生物信息

向TA求助
13902金币数
78210 经验值
432个粉丝
主页被访问 77992 次

3943 个回答

0 赞同

老师好,基因家族聚类结果怎么统计每个物种这两种情况的基因数量...

orthfinder 出来的有个表格,统计家族在不同物种中的数量的,你贴到excel里面自己也可以统计;

回答于 2023-12-12 11:14

0 赞同

做转录组数据分析的时候不出图

者不是都出图了吗?你打开看看的

回答于 2023-12-12 11:12

0 赞同

structure样品顺序问题

用-f 分组文件,和 -g  指定分组排序,你再看看视频 -s只是样本名字,没有排序;

回答于 2023-12-11 16:25

0 赞同

请问在进行MCScanX绘图那步是输出显示这样,没有图片出来是怎么...

看看你的collinearity文件有没有结果,没有结果当然跑不出来图来; 检查blast文件,gff文件有没有异常, blast文件生成比较慢,确保blast正确无误跑完;

回答于 2023-12-11 15:39

0 赞同

做群体遗传分析,需要把indel提取出来嘛只用SNP的vcf文件?

群体分析用SNP就行了,indel用的少

回答于 2023-12-11 10:21

0 赞同

请问在运行MCSCANX查找共线性时出现这个html文件是这样的,是怎...

gff和blast文件的前缀要保持一致,你看看的课程例子的:

回答于 2023-12-11 10:20

0 赞同

老师您好,我想做KaKs批量计算,但是我之前下载的版本是旧版本,...

这个在新课程里面已经更新了,你可以直接观看:https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp 如果过期,你可以看这个文章自己设置分析:https://www.omicsclass.com/article/1939

回答于 2023-12-11 10:15

0 赞同

请问命令怎么在服务器上跑

你有服务器,用putty连接服务器就可以输入命令在服务器上分析数据了; 我们组学大讲堂提供云服务器可以了解一下:https://study.omicsclass.com/index

回答于 2023-12-11 10:13

0 赞同

请问我把命令放后台,然后电脑关机想第二天在做的话,命令可以在...

你的命令在服务器上跑就行,服务器不关机

回答于 2023-12-08 20:05

0 赞同

blastp比对中,为什么相同的Query id与Subject id会有两条不同的...

blast为局部比对工具,两个比对上的位置不一样;

回答于 2023-12-08 20:04