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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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3954 个回答

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群体进化分析绘图

代码和镜像更新了,你需要重新下载代码和对应的镜像:https://www.omicsclass.com/article/2286

回答于 2023-11-15 17:05

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请问鼠标指的那个命令如果有两个结构域是要分别进行分析吗

对的,建议分开运行,

回答于 2023-11-15 17:03

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基因家族分析,保留蛋白编码基因的脚本

每运行一步检查一下输入输出文件,看看有没有异常, 有异常的脚本单独提问, 你这个可能是GFF文件格式出错了;

回答于 2023-11-15 17:02

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R gsl 报错

降低gsl的版本:devtools::install_version("gsl", version = "1.9-10")

回答于 2023-11-14 23:04

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启动镜像docker失败

你的事linux系统,在linux系统中使用docker你再看看视频课程:https://bdtcd.xet.tech/s/3Rcvt0 你需要把 D:\pop_evo 这个换成linux的路径;

回答于 2023-11-14 14:56

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当保留蛋白编码序列时,为什么会提示有这个报错?检查发现'!'应...

这是新版agat的bug,你删除镜像重新下载一下,更新一下, 这个已经在新镜像中更新解决了; 自己安装的AGAT需要自己手动解决bug:,60行修改如下:

回答于 2023-11-14 13:32

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老师我想做GWAS分析找油脂含量及相关脂肪酸的候选基因,可以通过...

对的,可以对多个品种叶片重测序,并调查表型 油脂含量,做GWAS关联就可以找到候选的和油脂含量相关的基因了; 可以学习课程:https://bdtcd.xet.tech/s/2KgXQq

回答于 2023-11-14 10:14

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如何对已经筛选的区域进行注释呢?

你说的注释,是基因功能注释吗? 这个可以使用eggnog等功能注释并做富集分析;这个可以看这个课程中:https://bdtcd.xet.tech/s/29EigM 非模式物质GO KEGG功能注释富集分析

回答于 2023-11-14 10:11

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老师好,在运行stringtie时出现了这个报错是什么原因呢?

threads这个变量设置了吗? 也有可能是软件编译问题,建议你换个电脑试试,最好是linux服务器;

回答于 2023-11-14 10:09

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请问老师R脚本运行后没有图片输出怎么处理?

镜像脚本已经更新,你更新一下镜像和脚本:https://www.omicsclass.com/article/2286

回答于 2023-11-14 10:07