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在构建进化树的时候，发现分组与拟南芥中的不同，比如A4分组被分...
进化树结构与预期不符解决办法： 1.调整序列比对结果，trimAL 参数调整 2. 构建进化树的方法换一下试试，NJ，ML等 3.如果是ML法，选择的核算或者氨基酸的替换模型可以换一下试试 建议看看进化树构建原理，希望对你有所启发：https://www.omicsclass.com/article/2010
回答于 2024-01-05 09:11
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有2个问题想请问老师，1基因名字字体过大，如何调整字体，2进化...
看看这个pheatmap参数调整 一下这个两个参数：https://www.omicsclass.com/article/1162
回答于 2024-01-04 09:39
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请问在引物设计时出现了这样的问题怎么解决啊？
你把这个文件default_settings.txt从sccripts文件夹拷贝到你的当前文件夹，才行； 或者按照课程里面的方式运行；
回答于 2024-01-03 19:21
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vcftools --vcf GT_AGCT_Liujingyan.vcf --max-missing 0.5 --ma...
vcftools 没有这个功能，你可以看看他的帮助：https://vcftools.sourceforge.net/man_latest.html
回答于 2024-01-03 11:14
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Gemma做GWAS的时候，用Gemma自带的文件运行时， mv ./output/kin...
看看文件路径是否正确吧，你检查路径：./output/kin.sXX.txt
回答于 2024-01-03 10:45
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Gemma做GWAS的时候，用Gemma自带的文件运行时， mv ./output/kin...
看看文件路径是否正确吧，你检查路径：./output/kin.sXX.txt
回答于 2024-01-03 10:45
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老师，如果基因家族鉴定出来只有几个，按照HKT那个文献说的也要...
不同物种搜索鉴定的时候可以分开进行， 最后绘图展示可以合并一起，比如进化树，不同的序列可以直接cat一起即可就可以做进化树了； 镜像随便用反复用都可以，有hmm模型可以不用blast鉴定；
回答于 2024-01-03 10:44