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老师，请教一下下载的参考基因组染色体名字不一样，有什么办法改...
用sed 搜索替换一下就可以； 例如： sed -e "s/chr1/DD_chr1/" -e "s/chr2/DD_chr2/" -e "s/chr3/DD_chr3/" genome.fa >geneome.new.fa
回答于 2023-11-06 12:07
老师，求助，转录组差异表达基因分析报错
missing values in 'row.names' are not allowed 有文件的第一列有问题，你检查检查的；
回答于 2023-11-06 12:06
没有 easySFS.py
刚刚试了下是有的，注意自己用的镜像版本 请更新镜像到v2.0 才有：https://www.omicsclass.com/article/2286
回答于 2023-11-03 10:20
重测序annovar注释
对的下载水稻的参考基因组，自己构建ANNOVAR的注释库才行，可以看看这个课程有视频课程：https://bdtcd.xet.tech/s/1VQOjQ
回答于 2023-11-02 23:12
请问老师，使用循环导致FORMAT后 样品名字识别错误 无法合并gvcf...
那是你的 生成bam文件的命令行写错了，才出现这个问题，你没有贴命令行，我也不知道你怎么写错了；
回答于 2023-11-02 23:11
新新新手提问！文件是Excle格式，怎么用R语言做进化树加热图呢？...
这个你可以看看这个扩增子分析课程里面有进化树分析才行：https://bdtcd.xet.tech/s/qZRiF
回答于 2023-11-02 23:09
老师，请帮忙，感谢。结果有参转录组5.deg报错。
你这个不要用记事本编辑文件，可能由于windows和linux文件编码不兼容带来不必要的报错，建议用专业的文本编辑器编辑文件： https://www.omicsclass.com/article/395 并且统一编码 UTF-8
回答于 2023-11-02 09:58
按照脚本做不出pca、structure图
这些命令不要忘记运行设置一下,课程里面都有讲解，请认真看看视频 /work/my_gwas/ 文件夹下有scripts这个文件夹吗？设置变量的时候还需要检查一下，这些文件夹路径是否正确
回答于 2023-11-02 09:17