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3961 个回答

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gatk call snp生成的vcf想要打开查看,提示是二进制文件?看不到...

压缩的,你解压一下试试;

回答于 2023-10-31 11:49

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请问这个

$gff 这个变量没有设置吧,你看看全面有没有命令漏掉了,没有运行;

回答于 2023-10-31 11:48

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请问蓖麻的dna序列和cds序列在哪下载

可以到一下基因组数据库查找下载:https://www.omicsclass.com/article/58 https://www.omicsclass.com/article/50 

回答于 2023-10-31 08:32

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老师您好,我根据教学指导试了很多次都不能将vcf文件转换成phy文...

用的是示例数据吗? 如果不是,自己的数据大,需要更多内存,这个可以设置一下:-Xmx5G 如果是windows中运行docker需要设置内存:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2023-10-31 08:29

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老师如果有服务器的话,是不可以不用下载docker

可以,但是 你需要把要用到的软件都安装一下,并且添加到环境变量中,设置配置好; 有了docker就不用配置软件环境了;

回答于 2023-10-31 08:27

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老师,请教一下,用gatk call g.vcf.gz格式的文件是,运行中断了...

哪个样本的gvcf中断了,就从那个样本开始跑

回答于 2023-10-30 15:22

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报错pi_manhattan_plot.r command not found…

看看这个同样的问题:https://www.omicsclass.com/question/4971  加下可执行权限,那些脚本cd $scriptdir && chmod a+x *

回答于 2023-10-30 13:40

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gvcf合并成vcf文件

只能和前10的gvcf合并

回答于 2023-10-30 13:37

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我做群体结构研究

看看这个同样的问题:https://www.omicsclass.com/question/4971

回答于 2023-10-30 11:51

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使用xpclr_smooth_line_plot.r绘制时,没有报错,但没有图片生成

看看 $FAI 文件里面的 染色体ID和你的 all.chr.xpclr 染色体ID是否一致; 还有就是 19226500 这个值表示小于这个长度的染色体会被过滤掉;

回答于 2023-10-26 12:28