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关于使用nohup vcftools过滤vcf文件的问题

nohup vcftools --gzvcf rice.raw.vcf.gz --recode --recode-INFO-all \    --stdout --maf 0.05 --max-missing 0.9 --minDP 2 --maxDP 1000 \    --minQ 30 --minGQ 0 --min-alleles 2 --max-alleles 2 \    --remove-indels 2>vcftools.log| gzip - >myresult/nohup1.vcf.gz & 试试上面的这个命令,并且看看这...

回答于 2023-10-23 16:57

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PASA预测基因数目过少

真菌的基因特点大多为单外显子,你需要设置参数避免过滤掉太多信息;

回答于 2023-10-23 11:20

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想做GWAS练习,但进入不了助学大讲堂的镜像

你看看docker的基础用法, 你这个报错可以看看英文提示,说你后台已经有了一个gwas名字的容器,不能再启动相同的容器; 你可以 docker ps 看一下后台的容器,同时这里也有关于docker 的常用命令说明,可以看一下

回答于 2023-10-23 11:09

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专家你好 ,最近手头有一份全基因重测序数据,本人骨科专硕难以...

这个解读起来涉及很多基础知识,你花钱在那个公司做个项目,他们应该用售后服务帮你解读的;不行再来找我们

回答于 2023-10-23 11:03

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mysql database里找不到文件

用不了 mysql 该用sqlite数据库吧;

回答于 2023-10-21 10:09

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docker desktop命令不能运行

看看这这个设置一下:https://www.omicsclass.com/question/4105

回答于 2023-10-21 10:08

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请问一下我们用Orthofinder运行结果做花瓣图得出某个物种的特有...

有个文件 *data_for_venn.tsv;这个文件记录了不同个体基因家族的ID有无情况,筛选这个表即可;

回答于 2023-10-19 13:37

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转录组热图绘制,表头顺序错乱

绘图时不要设置列聚类样本聚类,这是聚类之后的结果: 看看这个:https://www.omicsclass.com/article/1162

回答于 2023-10-16 15:55

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群体重测序, 进化树中如何添加外群?

你的物种和拟南芥一起找到基因组同源的区域SNP放在一起做进化树即可;

回答于 2023-10-15 08:16

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挂载共享文件夹失败mounting failed with the error:no such de...

我们不用v-box了用docker吧:https://www.omicsclass.com/article/1198

回答于 2023-10-15 08:14