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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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Tassel做GWAS分析时混合线性模型报错,有老师知道是什么原因吗?

看看有么有输出,没有输出可能是输入文件格式问题,或者电脑内存不够:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2023-09-21 18:24

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基因组重测序,排序完后进行去重复总是被Killed

数据量大,需要电脑内存足够才行,不然系统会自动杀死:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2023-09-21 18:23

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老师,您好,我在原版的XPCLR分析时得到最后的XPCLR_score,但是...

我们群体遗传进化里面有讲解,你自己设置相同的窗口大小和步长即可:

回答于 2023-09-21 10:03

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genome-annotation缺失tantan

我们的代码和镜像都是经过测试的;按照课程练习使用一般不会由于软件安装问题报错; 你这个可能是命令使用错误导致;

回答于 2023-09-21 07:23

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注释脚本

基因组注释脚本在课程里面需要购买:https://bdtcd.xet.tech/s/2TnPfm

回答于 2023-09-21 07:21

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在gwas分析中,单一线性模型没有问题,混合线性模型运行到30%就...

看看有没有结果,有结果就没事; 如果没结果,可能是电脑内存不够:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2023-09-21 07:19

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同一物种批量注释基因组

这个有些步骤可以简化的,比如 重复序列,有了repeat库,直接用这个库repeatmask注释就行;  基因注释可以用注释好的基因作为参考,

回答于 2023-09-20 20:25

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mcmctree能否多线程运行?

不能多线程,只有单线程; 如果太慢建议用BV方法:

回答于 2023-09-20 10:35

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水稻F2群体株高性状的GWAS分析模型选择GLM还是MLM

如果没有群体结构的话优先选择GLM; 也可以尝试MLM 具体可以看课程:https://bdtcd.xet.tech/s/2KgXQq 模型没有好坏,最适合自己数据的模型就是好模型; 各种关联模型都可以试一下,哪个关联的结果好选用哪个

回答于 2023-09-20 10:35

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老师好,我在运行比较基因组学11.time_tree_BV脚本的时候,报错E...

对的,你再检查化石时间设置的

回答于 2023-09-18 12:07