回答问题 · 2019-11-11 16:47 老师,请问我在做基因组间共线性分析,我的gff 文件,和cds 文件格式如下,如何修改这两个脚本文件get _gene _bed.pl和get _fa _by _bed. pl ,才能提取成功进行下一步分析,谢谢!!
发起提问 · 2019-11-11 16:41 GEOquery包的getGEO函数无法下载 无法与服务器建立连接
回答问题 · 2019-11-11 16:00 老师,比如hmmsearch 的输出文件WRKY_domain_new_out.txt只能筛选50个ID信息,而我想输出列表筛选显示更多的ID,将E值调大,怎么做
回答问题 · 2019-11-11 16:00 关于TCGA的下载,学了课程还是遇到点问题,求老师指点
发表了文章 · 2019-11-11 14:32 GEO数据库的搜索下载数据技巧
回答问题 · 2019-11-11 13:55 请问老师,gff 文件中有id 信息,但是cds 文件中只有转录本信息,如何进行修改课程脚本,进行cds 提取啊!
回答问题 · 2019-11-11 13:55 老师,请问我在甘蓝型油菜A09 染色体定位出一个区段200kb ,如何找出他在白菜A09 染色体上的同源区段啊,谢谢!!
发表了文章 · 2019-11-11 13:50 GEO 数据介绍及在线下载
回答被采纳 · 2019-11-11 12:37 老师,我们之前在NCBI已经上传过一株弧菌的二代测序基因组序列,现在想上传同一株菌的三代测序全基因组序列,想问下老师,Bioproject号是用之前二代序列的那个呢、还是重建一个呢?然后申请完bioproject和biosample后,对三代序列上传的位置
回答问题 · 2019-11-11 10:26 老师,您好。我完全按照视频课程整理好自己的数据,按照相同的操作,案例数据可以出图,自己的数据却不行。您可以指导一下么?我的OTU ID不对么?还是我的丰度值太大呢?我没有搞明白我的数据错在哪里还是说筛选的时候要更改设置?感谢!