发起提问 · 2019-12-07 17:37 老师,你好。在做有参转录组分析,准备的文件有基因组注释文件gtf,cds,pep(其中cds,pep都是fasta格式的序列文件),命令如下。其中第一个截图是参考pep文件,比对率为0,;第二个结果是参考cds文件,比对率为57.81%,比较低,这是哪里出
登录 · 2019-12-07 17:26
发起提问 · 2019-12-03 10:42 老师,您好,我是在做有参转录组分析。在对基因组构建HISAT index时,所产生的splicesites.tsv,exons.tsv文件大小为0,但是并没有报错,请问这是什么原因呀,命令如下
登录 · 2019-12-03 10:36
登录 · 2019-09-29 00:23
登录 · 2019-09-28 10:10
发起提问 · 2019-09-27 16:33 老师,你好。在做有参转录组分析,转录本基因表达量出来之后,发现里面找不到我期待的同源基因(ID),不过里面发现了好多MSTRG.这样的ID,问题是这些ID在我的注释文件里根本没有,详细情况如下
注册 · 2019-09-27 15:45
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发起提问 · 2019-09-17 21:46 转录组基因表达差异分析分组问题,我是有3个样品数据,如下分别是Carambola_K007-01-T01(花序),Carambola_K007-01-T02(花苞),Carambola_K007-01-T01(叶),该如何分组呢