发起提问 · 2019-12-04 15:55 一个基因的domain在不同的数据库网站上的注释长度不同,比如在CDD上1-30,在RGAP上1-31。我是否可以在在构建进化树时,同一使用CDD注释的长度。
签到 · 2019-12-03 21:16
登录 · 2019-12-03 18:06
发起提问 · 2019-12-03 16:32 老师,构建进化树时,个别家族成员保守域太长或太短,导致无法构建进化树,请问怎么解决?
发起提问 · 2019-11-27 12:29 发现一个基因通过domain_xulie.pl提取的位置与SMART鉴定时的domain、cdd的domain的位置不一样,有长有短,怎么办
发起提问 · 2019-11-27 12:28 发现一个基因通过domain_xulie.pl提取的位置与SMART鉴定时的domain、cdd的domain的位置不一样,有长有短,怎么办
发起提问 · 2019-11-12 17:06 老师,我发现同一物种在不同的网站下载的cds,pep,gff文件信息有些不同,比如有个转录本信息在NCBI下载的cds文件中就可以找到,在jgi下载的cds文件中就没有。这样鉴定的成员数目是不是就不对呢
发起提问 · 2019-11-12 16:58 老师,一个物种的某个基因家族基因鉴定完成,我还有必要再次鉴定其数目吗,还是说按着已发表文章家族成员,继续向下分析。
发起提问 · 2019-11-11 15:31 老师,比如hmmsearch 的输出文件 SAUR_domain_new_out.txt只能筛选50个ID信息,而我想输出列表筛选显示更多的ID,将E值调大,怎么做
签到 · 2019-11-11 13:19