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15 个问题
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发布日期
5
老师您好,在用mcscan分析之前发现,gff文件里没有gene,只有cds和exon怎么处理?
1/2931
2020-03-07 10:05
请问老师,GFF文件里,好多个蛋白对应的基因高都相同(重复)是怎么回事?如图为筛选后蛋白对应的基因号,起始终止位置倒是不同。这是什么生物学现象吗还是错误
已解决
1/2128
2020-03-06 10:38
求助大佬笔记本购买相关# 现在用一台五年前笔记本,i5,12G(4+8应该不能组成双通道吧),gtx960显卡,无固态。不是纯生信专业,也就做做基因家族分析和转录组分析,如果不想上台式的话,买什么配置的笔记本体感提升会非常大呢?另外如果买macbook的话普通生物软件全不全?毕竟还要做湿实验
已解决
1/3538
2020-03-04 22:00
10
老师您好,做基因家族分析有几个问题不明白想问问您:(1)实在找不到组装到染色体的基因组,可以用scaffold水平的画基因重复性图吗?会不会影响发文章 (2)能不能分析两个比较有相关性的基因家族或者结合转录组分析,增加一点文章接受几率?(3)用hmmsearch筛选蛋白,构建新模型,再筛选,筛出来200多个蛋白,但是alignment之后发现保守结构域差别很大,gap特别多,是出了什么问题吗?
已解决
1/2996
2020-03-04 14:56
求助大佬,想做基因家族分析,目标物种在网上只有三个组装的基因组,JGI上和NCBI其中一个都没有组装到染色体层面,NCBI另一个组装到染色体了,但是没有gff文件和蛋白序列,这种情况应该怎么办?不能做与染色体位置有关的分析了吗?
已解决
1/3490
2020-03-04 03:10
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