安生水的回答 - 组学大讲堂问答社区

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请问老师，出现这种情况该怎么解决。我这是在做基因的顺势作用元...

用head命令查看文件： head mrna_location.txt

回答于 2019-04-03 17:05

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检查一下 bed文件和cds 文件基因ID格式是否一致。

回答于 2019-03-29 15:27

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blast比对是基因与基因之间进行比较，基因组序列比对没有意义。

回答于 2019-03-29 15:21

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linux与Windows是两个系统，share目录需要提前创建好，可以用 mkdir share 命令创建，然后将共享文件夹挂载到 share 目录下。

回答于 2019-03-27 09:31

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可以使用以下命令： sed 's/_P/_T/' 蛋白质文件名 > new.name 最好确认一下有没有替换成功。

回答于 2019-03-20 15:25

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构建进化树通常用参考基因组基因序列，不太明白你是要做什么

回答于 2019-03-19 11:45

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内存最多只能分配50%，你设置900MB吧。还有你电脑的内存比较小，运行可能比较卡。

回答于 2019-03-18 09:27

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对的，上图红框中的脚本生成的

回答于 2019-03-15 09:15

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把你的输入文件贴一下

回答于 2019-03-13 11:51

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最好不要用NCBI下载的基因组数据

回答于 2019-03-11 09:19