安生水
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擅长:perl,基因家族,linux,chip-seq

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165 个回答

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circos绘制基因组共线性图绘图命令运行问题

使用pwd命令,看一下你当前目录是否在/home/manager/share1/cir/ 下。

回答于 2019-02-21 10:45

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学习中遇见的问题

序列较多时meme分析速度较慢,耐心等待即可

回答于 2019-02-21 10:37

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"组学大讲堂"--Linus常用命令处理生物数据,这一课的免费视频在...

linux命令处理生物数据链接:https://study.163.com/course/courseMain.htm?courseId=1004709009&share=2&shareId=400000000234009, 这文课程知识基础的,进阶可以学习 Linux系统的使用(生物信息)。

回答于 2019-02-15 12:03

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家族基因鉴定

最好把你的命令以及输入文件都截图一下,不然我们找不到问题

回答于 2019-02-15 09:21

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bio-linus ova包在百度网盘的pan.baidu.com/s/1bMOLEu这个地址已...

您可以到这下载:https://pan.baidu.com/s/1ui9ndOsjbtgHrJoxxOcTMQ,这个安装包里有我们安装的一些软件,文件较大。也可以去biolinux官网下载,部分软件可能需要自己安装。

回答于 2019-02-15 09:18

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关于python版本的MCScanX绘图问题

你的图里有些线比较粗,也有可能是条线重合在一起了

回答于 2019-02-14 13:36

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MCScanX共线性图与拟南芥示例有些不一样

应该是共线性关系太多了,你可以看一下共线性关系的文件

回答于 2019-02-13 13:14

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基因结构

文件没问题的话,应该是可以出图,这里可能有什么bug或者文件的问题。你也可以用TBtools作图,这有篇文章你可以借鉴参考 :https://www.omicsclass.com/article/382

回答于 2019-01-24 17:44

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MCSCANX共线性图代码报错,看了其他提问和回答没能解决。

你确认一下AT.gff 中是否包含family.ctl中的8条染色体,并确认一下染色体ID是否一致。

回答于 2019-01-24 14:04