安生水
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擅长:perl,基因家族,linux,chip-seq

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165 个回答

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老师,您好!在进行python版mcscan 共线性分析时,当执行#绘制共...

能把你的输入文件截图看一下吗

回答于 2019-08-13 14:45

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求助get_gene_position.pl这个脚本

什么问题呢,你得把问题描述一下,最好有报错信息和输入文件截图。

回答于 2019-08-12 09:32

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构建进化树bootstap值自动变动及结构域的选择

第一个没关系,继续往下进行就可以。通常会删除结构域不完整的序列,例如只有正常结构域一半的或差距较大的。

回答于 2019-08-12 09:31

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老师您好,我鉴定了一个基因家族,但是每个基因的转录本很多,我...

我们是提取第一个转录本分析用于分析的。

回答于 2019-08-09 11:30

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在计算Kaks时,想提取多对基因的序列,怎么批量提取?

如果自己不会写或者想节省时间,可以参考这篇文章:https://www.omicsclass.com/article/968 ,这里有现成的脚本。

回答于 2019-08-09 10:15

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老师,我把截图发给您了,您看一下

文件应该没什么问题,看了下你的报错信息,应该是你的perl没有安装 Bio::SeqIO模块。你一下吧,如果不会的话可以百度。

回答于 2019-08-05 15:43

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我在用完hmm搜索后提取序列提不出来,请问一下是怎么回事

请将你的输入文件截图发一下

回答于 2019-08-02 17:30

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在鉴定长链非编码RNA分析中,合并转录本之后,如何批量从gffcmp....

建议学一下Perl语言或Linux命令,方便进行批量操作。

回答于 2019-07-31 10:32

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我的转录本数据和gene ID不一致,所以我用的转录本ID来做的circl...

请将你的输入文件全部截图

回答于 2019-07-29 09:22

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smart批量分析结构域 所有均为 no match

会遇到这种情况,可能由于smart数据库比较老,所以检测不到你的基因家族。就以另外两个数据库为准吧。

回答于 2019-07-26 13:37