Daitoue 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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转录组数据分析，差异基因的功能在GO和其他数据库（NR, Swiss_po...

一个gene 本身在不同的数据库中注释就会不一样，毕竟各数据库对应的注释信息不是同一类型，kegg pathway数据是涉及相关通路的注释信息，可能就是你这个gene没有对应的信息而已。如果不肯定结果你可以自己去kegg数据库进行注释试试。可以参考一下：转录组标准分析后的数据挖掘

回答于 2019-07-03 14:03

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这个问下万能淘宝吧

回答于 2019-07-02 09:30

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多序列比对之后删除gap区域吧，如果这种大量删除gap还不行，考虑用domian区域的序列构建进化树试试

回答于 2019-07-02 09:29

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批量还是单个？这个拿ID搜索一下，批量ID搜索就用excel 里面vlookup吧转录组标准分析后的数据挖掘

回答于 2019-07-02 09:27

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其他的网站有一些miRNA克隆的的实验方法相关的介绍譬如丁香园之类的，你也可以去查查相关的文献

回答于 2019-06-28 16:16

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我这边尝试是直接不出任何结果，网络有点问题，你检查检查网站对于输入文件的要求是不是符合，或者设置选项的类型是不是符合

回答于 2019-06-28 16:14

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这个应该是图形显示的问题吧，不表示进化树有错误

回答于 2019-06-28 08:59

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它都已经提示你了，你的表格信息填写的不够，没有区分开所有的样品，参考一下，调整表格填写：NCBI数据上传

回答于 2019-06-26 09:49

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如果确定pfam号没错，看看输入的序列文件吧，是所有的蛋白序列还是部分序列，还有分析的时候输入命令的相关参数，试着看看能不能调整，如果真的全都没有考虑基于其他方法进行鉴定吧，譬如利用拟南芥或者其他物种的BHLH蛋白序列作为种子序列进行blast比对，找到你物种里面相似序列这种方法进行吧

回答于 2019-06-26 09:46

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参考一下这个：https://www.omicsclass.com/question/920/answer/1005

回答于 2019-06-24 16:40