Daitoue
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老师,这个热图我想把左边和右边聚类的那量块儿结合挨起来,有没...

问题描述的不太明白,我猜测你是说列聚类的结果不理想,有颜色的色块不是在一起,见下图圈中区域,事实上聚类的结果是没办法改的,列聚类显示他们确实过远,如果不希望分开,可以选择不进行列聚类,固定列的顺序 结果会不一样。 另外,单纯利用原始数据画图不做转换,对应的颜色会不明显,建议是可以做数据转换的,log 或...

回答于 2019-05-30 13:51

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各位大神,请问有关于RN各位大神,请问有关于RNA突变或者基因突...

这个google学术搜一搜吧,不同的专业涉及面不一样,自己动手搜索搜索可能会发现更多。 https://scholar.google.com/

回答于 2019-05-30 10:25

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老师 在做WGCNA分析中,只有一份表达数据 没有性状数据。。能仅...

参考课程WGCNA-加权基因共表达网络分析 ,课程中有明确说明那些步骤是结合性状进行分析了,仔细听课就能知道了,而且课程直接提供了没有性状数据的脚本,只需要修改简单的输入数据和个别参数就能直接运行。

回答于 2019-05-30 10:21

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WGCNA软阈值选择

具有生物学意义的是R2>0.8  部分会提高阈值到0.9  同时保证连通性较高,你这里没有高于0.9的 直接用0.8的吧 取4计算看看结果好坏。

回答于 2019-05-28 17:43

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三代全长转录组数据如何鉴定新的转录本

应该是合并高质量的吧,毕竟可信度高的,看看官方有没有提供对应的分析思路

回答于 2019-05-28 09:04

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用hmmer提取物种结构域时,结构域文件是空的

hmmer提取结构域?你确定没说错么。。。。。。hmmsearch 搜索具备某结构域的蛋白?

回答于 2019-05-24 09:08

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老师你好,我想问一下,我想用其他物种的一条蛋白质序列搜索小麦...

blast可学习一些 获得小麦的基因序列或者蛋白序列,建库进行比对 不同的库 比对命令部分将有所差异 ,具体了解:https://www.omicsclass.com/article/269

回答于 2019-05-22 18:01

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请问一下,自己找关于基因家族分析的课题有什么注意事项,找家族...

1、如果目前自己实验室有目标研究物种 用这个就可以了,毕竟熟悉,确定该物种有参考基因组信息,这些信息完整 2、找几个相关的家族,通过查阅大量文献了解其基本功能,并确保没有相关重复内容的文章出现, 3、如果和前期实验室基础结合,有新意又避免和他人内容雷同 主要的还是读文献,了解这个方向的内容 结合当前相...

回答于 2019-05-22 09:18

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基因家族课堂中circos美化图片课程中,有一个colline_v2.pl,请...

对应课时下面有压缩包,

回答于 2019-05-21 09:29

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老师,mapchart时为什么会显示位置错误?我把这个基因删了还有下...

图片挡住了看不到  一般原因时由于染色体上没有将基因按照位置从小打到排列,必须  必须 必须 按照染色体上的位置从左到右(从小到大)列举基因, 具体可以参考下方两个链接: https://www.omicsclass.com/question/980 https://www.omicsclass.com/article/397

回答于 2019-05-21 09:23