Daitoue
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373 个回答

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老师,我用perl script/domain_xulie.pl去除冗余,最后生成文件...

这个脚本是提取序列的吧,不是去冗余的 最好贴清楚你运行的命令、生成的结果、结果内容展示(屏幕截图贴上,完善问题)

回答于 2019-03-20 12:41

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cdt和gdr文件如何查看?

看你写的分类是GEO,你下载的是原始数据吧,这个一般不直接打开,借助其他的软件或者包才可以~

回答于 2019-03-20 10:26

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老师您好,我想问一下关于双通道芯片转录组数据分析的相关课程和...

目前没有双通道芯片的分析课程,你可以基于下载的标准化数据,中的M值初步看看差异变化

回答于 2019-03-20 10:17

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circos图如何将指定基因名称标记出来?

可以参考 基因家族分析实操课程 关于课程中基于circos软件绘图部分的课程,初步入门可以看看文章:https://www.omicsclass.com/article/644 

回答于 2019-03-20 09:16

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如何通过GEO数据库中的数据得到某个基因表达量?

你可以参考我们的课程:GEO芯片数据挖掘、GEO芯片数据标准化

回答于 2019-03-20 09:13

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请问在基因家族课程中的domainxulie这个脚本提取出来的保守结构...

可以基于domain序列进行多序列比对并建树

回答于 2019-03-19 16:20

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生存分析中单因素cox循环的问题

Unicox() 是一个自定义函数吧,参数需要传进去,对谁(x) 进行Unicox,目测你应该是要把test_var作为参数 进行分析  ------也就是      Unicox(test_var)

回答于 2019-03-19 09:48

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conet构建网络

三个样本构建网络是不合理的,还是相同处理。。。 至于跑很久没出来,每个参数都有可能,数据也有可能,或者电脑配置低都是可能~~

回答于 2019-03-18 09:25

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用Conet对Otu构建网络时,参数的设置问题

1、参数写错了,input filter---method--row minocc  视频已经解释了它的意思了(注意听),大小根据样品数确定(以及严格标准确定,不超过样品数) 2、可以设置阈值的(见图片圈中区域),和后期设置不矛盾,这里是把符合相关性计算的结果提取出来 构建网络而已,而后期设置阈值edgeNumber Top and bottom等,是从整个构建...

回答于 2019-03-15 09:51

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结合转录因子

参考参考这个课程:转录组标准分析后的数据挖掘 可能有用

回答于 2019-03-15 09:34