最好学会用sci-hub,外文文献就不用担心了 Attractive but Toxic_ Emerging Roles of Glycosidically Bound Volatiles and Glycosyltransferases Involved in Their Formation.pdf
回答于 2018-10-29 14:16
字体可以通过配置文件中plots下面的label_font 和colors之类的参数修改,不知道你说的是不是这一类,你可以参考课程:https://www.omicsclass.com/video/27 试试
回答于 2018-10-29 10:08
参考一下这个:https://www.omicsclass.com/article/26
回答于 2018-10-29 10:05
它在提醒你要不要更新旧的R包,a/s/n 表示all/some/no 你敲一个字母选择更新所有部分还是不更新就好了,多数情况可以选择n
回答于 2018-10-29 09:31
虽然大于0认为是表达(实际上有的时候,检测小于0.05的时候就认为没有表达,统一归为0了),但是更多的文献认为FPKM大于等1 是有效表达,值越大也确实是表达水平高。 最好是理解FPKM 和TPM计算公式的意思。
回答于 2018-10-26 16:04
样品聚类树高度能反映样品的离群程度,比较远的表示这些样品可能存在异常,样本分布不均衡,会影响网络模块分析结果,故剔除这些样品,而实际的结果一般通过聚类树具体的情况判断,设置阈值进行剔除。你这个图片的标准多数时按经验来的,譬如你明显看到了这四个样属于离群状态,所以设置一个高度进行了剔除,裁掉"树枝”中“...
回答于 2018-10-25 10:15
power 7的数据可以,具体的分析需要查看后期模块形成之后结果是不是好。如果模块划分结果比较理想,基本上是可以的
回答于 2018-10-15 09:40