Daitoue
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转录组中的Log2(FC)

完善问题内容~不然没人能看懂

回答于 2018-10-30 11:15

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Attractive but Toxic: Emerging Roles of Glycosidically Bound...

最好学会用sci-hub,外文文献就不用担心了 Attractive but Toxic_ Emerging Roles of Glycosidically Bound Volatiles and Glycosyltransferases Involved in Their Formation.pdf

回答于 2018-10-29 14:16

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circose绘图,共线性基因,在途中的字体和颜色怎么修改??

字体可以通过配置文件中plots下面的label_font 和colors之类的参数修改,不知道你说的是不是这一类,你可以参考课程:https://www.omicsclass.com/video/27 试试

回答于 2018-10-29 10:08

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请问有没有预测转录因子对靶基因作用的网站?我看视频中用cytosc...

参考一下这个:https://www.omicsclass.com/article/26

回答于 2018-10-29 10:05

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双击virtualbox后出现这个错误,请问怎么解决

点开明细查看它对你的提示

回答于 2018-10-29 09:32

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老师,请问我验证R里面的安装包是否安装成功时,出现这样的结果...

它在提醒你要不要更新旧的R包,a/s/n 表示all/some/no 你敲一个字母选择更新所有部分还是不更新就好了,多数情况可以选择n

回答于 2018-10-29 09:31

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关于转录组结果分析视频中FPKM值的意义

虽然大于0认为是表达(实际上有的时候,检测小于0.05的时候就认为没有表达,统一归为0了),但是更多的文献认为FPKM大于等1 是有效表达,值越大也确实是表达水平高。 最好是理解FPKM 和TPM计算公式的意思。

回答于 2018-10-26 16:04

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去除异常样本的标准

样品聚类树高度能反映样品的离群程度,比较远的表示这些样品可能存在异常,样本分布不均衡,会影响网络模块分析结果,故剔除这些样品,而实际的结果一般通过聚类树具体的情况判断,设置阈值进行剔除。你这个图片的标准多数时按经验来的,譬如你明显看到了这四个样属于离群状态,所以设置一个高度进行了剔除,裁掉"树枝”中“...

回答于 2018-10-25 10:15

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热图中基因名称的显示

补充问题: 1、绘图软件? 2、数据格式? 3、预期案例?

回答于 2018-10-23 17:23

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WGCNA分析没有给出powerEstimate,如何选择power值/β值?

power 7的数据可以,具体的分析需要查看后期模块形成之后结果是不是好。如果模块划分结果比较理想,基本上是可以的

回答于 2018-10-15 09:40