Mapman里面导出的图片也就宽度上可调(还有最大限制),导出的图片你参考一下文章:https://www.omicsclass.com/article/330 去photoshop里面调整吧
回答于 2018-08-03 13:05
1、boxplot那个outline=F并不是纠正,而是在图片未将异常值没有显示出来 2、并不一定有问题,如果这个是数据结果中线的颜色重合度较高,代码并没其他报错的情况下,一般是数据密度分布趋势过近导致的
回答于 2018-08-01 16:43
1、利用自己研究物种的全基因组的fa文件,蛋白或者DNA序列进行建库,主要命令参考makeblastdb 2、基于已知的基因或蛋白序列进行本地blast比对,具体参考blast相关命令
回答于 2018-07-30 10:30
1、一般差异基因的筛选是针对不同样品组成的差异对比分组进行分析获得,而此对比组样品的基因表达量是依据相同的参考基因组分析之后进一步分析获得的,虽然我不知道你差异分析的时候怎么做到的,毕竟你也说到了不同基因组注释信息差异,编号不一样,你怎么统一编号做的差异比较呢?这样比较可靠性如何。 2、如果差异比较能...
回答于 2018-07-27 16:45
你这个问题最好细节描述一下,或者给一张示例图什么的?不知道你指的是不是无参转录组里面 NR数据库的比对结果,结果一般是类似下面这张图片: (图片摘自:基于RNA-seq技术对乌鳢和斑鳢肝脏的转录组分析,刘凯,2015) 首先确保本地建库过程中包含物种信息; 无参转录组分析,通过denovo组装获得unigenes,利用这些...
回答于 2018-07-24 17:05
你需要再细节描述一下你的问题,或者提供一个示例图片,如果没有理解错误的话应该是下面这张图片吧。 1、图片的概念应该说是判断哪一个性状和哪一个模块相关性更高一点,目的其实可以理解为,那一些基因对这个性状更重要,譬如红色模块对一个性状具有高相关性(无论正相关或者负相关)说明这个模块内部的基因表达上...
回答于 2018-07-24 09:34
为了防止代码文件出现中文乱码,一般在Rstudio中,都要求将文件保存为UTF-8格式,同时打开显示也要求以UTF-8格式进行显示,具体的的设置方式可以参考: Rstudio 防止中文乱码(保存与显示) 其他编码格式设置问题类似。
回答于 2018-07-17 12:07
有可能是分隔符问题,查看以下分隔符是什么吧,,read.table,sep有默认的分隔方式,你的文件读取的时候最好指定一个,例如指定sep="\t"
回答于 2018-07-17 09:36