Daitoue
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WGCNA 模块特征热图意义

上图只是显示一下该模块内基因的表达数据情况,如果想知道模块和某个处理(形状)是否关系密切 建议看相关性热图,计算模块和性状之间的相关性 p值等。

回答于 2019-07-31 12:42

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补充细节: 运行WGCNA代码后,12_Network heatmap plot_all gene...

确实是那一步错了,运行代码失败,最好查看前面具体的情况,另外运行日志最好截个全图补充一下,单独看这个看不出来,只能知道写pdf的时候是出现了问题的。

回答于 2019-07-30 10:28

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运行WGCNA代码后,12_Network heatmap plot_all gene.pdf 这个文...

肯定中间是有报错没画上,出现这种问题的检查代码运行情况

回答于 2019-07-29 10:32

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WGCNA分析中,模块保守型分析需要两类样本的基因数目一致么

一致性网络是得数目一样

回答于 2019-07-25 09:12

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有人用过GGT2.0吗

可以参考软件文章:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18222930

回答于 2019-07-23 14:30

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WGCNA 离群样本

0.2应该有两个离群,不太能看出来另一个枝的高度,那一个可能也贴近那个高度,主要看树的分枝,样品高度

回答于 2019-07-22 13:13

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基因家族分析预测顺势原件时,得到的Ptomoter文件中原来43个基因...

29+19?43?我有点晕,如果没有的话,看一下这个基因位于的染色体(或者scaffold)的位置,可能上游过短,提取设置的长度超过这个,就提不出来了

回答于 2019-07-19 09:22

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biolinux导入虚拟电脑失败,报错 返回 代码: E_INVALIDARG (0x8...

从图片中明细位置,点击展开查看详细的信息,这个信息太少了

回答于 2019-07-18 17:58

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请问有没有二穗短柄草的表达量数据库?

专门的数据库不知道,但是你可以去NCBI的GEO数据库看看有没有对应的物种表达数据

回答于 2019-07-17 17:45