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老师,我看的大讲堂里geo的标准化的课程,课程里经标准化后基因的表达值变成(964319764916794;9)这种形式,每个R包都是这样,如截图所示为课程参考资料的文件,请问这是什么意思?(请您仔细看下截图,谢谢)
0/2191
2020-07-29 14:35
老师,您好,我下载下geo原始数据,经标准化处理后,基因的表达值显示为 964316794613767;9 这是什么意思,不是说过表达值经log处理基本上在0-几十的样子,怎么变成这样了?这两个数字代表什么意义?
1/2800
2020-07-27 17:29
geo数据库中,双通道的矩阵与单通道的矩阵(均已标准化并取log值)都是可以进行WGCNA的吧,如果是的话,那两者的r语句应该是一样的吗?
1/3348
2020-07-23 21:11
请教你个问题,如图所示
1/2500
2020-07-23 20:06
第一张图是geo直接下载的矩阵文件,是经校准的log数值,而在按照大讲堂标准化处理的课程,我标准化处理后形成的文件不是矩阵类型,而且每个基因的值是 “一串数字;个位数”的格式(如图二所示),请老师解释一下这种数值是什么意思,我应该如何转化成矩阵那样的数据呢?
1/4558
2020-07-23 19:48
5
如果geo下载的矩阵是标准化的但没有去log,那我利用这个矩阵用Excel计算出log值以后再用lima包进行差异分析吗?还是说需要重新下载原始数据用r进行标准化处理呢?
1/3048
2020-07-23 16:12
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