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基因家族表达量热图的时候没有找到合适的FPKM文件
你做的A种，却用B种的转录组数据去看A种的家族成员的表达模式，这不合理吧？建议还是去找A种的转录组数据，或者自己测一下。
回答于 2023-08-03 15:20
iqtree2 -s supergene.phy -st DNA -T 2 -mem 8G \ -m GTR...
你好，你这个问题不是课程代码问题，有点超纲了，你可以试试以下建议：要在 iqtree2 命令中添加外类群分析，需要使用 - [&lt;taxon>|=<treefile>" 选项来指定外类群的名称或文件。例如：iqtree2 -s supergene.phy -st DNA -T 2 -mem 8G -m GTR -redo -B 1000 -bnni --prefix iqtree - [&outgroup]
回答于 2023-08-03 15:14
NCBI上下载的CDS序列的ID和GFF文件的ID对不上，导致CDS提取失败...
建议不要用NCBI上的数据，格式混乱，首选ensembl等其他基因组数据库数据
回答于 2023-08-01 19:04
老师，您好，我想咨询一下转录组测序相关系数的问题。
说明你的组内样本差异比较大，这个数据不是很好，这样会滤掉很多差异基因，数据可不可用不太好说，肯定会漏掉一些信息。
回答于 2022-09-09 10:18
基因组质量比较差，处于草图阶段，可以做基因家族分析吗？
也能做 就是效果差呗 有的还用无参转录组的数据做基因家族分析呢 没装到染色体水平有些分析也做不了，比如染色体定位、大片段复制、物种间共线性分析等
回答于 2022-03-28 09:07
老师，我想问一下我的无参转录组数据不是全长，它是不是叫cds序...
无参转录组组装出来的是转录本，可能不是转录本全长，要全长的话需要race。CDS是指编码蛋白的序列，是有区别的，这些概念是需要清晰的弄清楚的，要多学习啊！可以看下这个只是介绍：https://www.omicsclass.com/article/805；
回答于 2022-03-03 11:38
安装Docker Desktop报错 WSL 2 installation is incomplete.
应该是wsl2版本老了，需要我们自己手动更新一下，可以根据提示去微软官网下载最新版的wsl2安装后即可正常打开。
回答于 2021-08-06 16:24
docker vitualbox安装报错：Unable to start the VM: C:\Program...
建议：先通过安全卫士卸载掉VirtualBox，然后从https://www.virtualbox.org/wiki/Downloads 下载最新版本的VirtualBox你，安装完成后再启动docker的客户端，理论上就可以解决了。
回答于 2021-07-29 19:43
请问怎么找一个基因来做基因家族分析呢？
做基因家族分析一般先会锁定一个关注的性状，然后在通过文献看下和这个性状有关的家族信息，假如你研究的物种中这个家族还未被系统鉴定过，那你就可以鉴定分析了。所以，读文献是关键。
回答于 2021-05-19 15:56