基因组下载学习链接:https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyNzIyNTczNA==&mid=2247486726&idx=1&sn=cad82d7a2f1b2f3f523cf77fbc1438c9&chksm=e86534efdf12bdf9ce1666a085ee28621cae54be92e9787f5ba5612952973c64c6d2616f12fd&token=819885636&lang=zh_CN#rd
回答于 2019-03-31 19:15
你好,可以试着学着自己下载基因组,学习链接:https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyNzIyNTczNA==&mid=2247486726&idx=1&sn=cad82d7a2f1b2f3f523cf77fbc1438c9&chksm=e86534efdf12bdf9ce1666a085ee28621cae54be92e9787f5ba5612952973c64c6d2616f12fd&token=819885636&lang=zh_CN#rd
回答于 2019-03-31 19:13
血浆样品:EDTA抗凝剂和蛋白酶抑制剂的血常规管采集血液;轻轻地上下颠倒混匀 8-10 次;立即4℃,1600 g离心 10 min;将血浆转移到离心管中,加入蛋白酶抑制剂,混匀,瞬时离心。 血清样品:真空采血管收集血液;轻轻地上下颠倒混匀5-6 次;4℃,静置15-30 min;4℃,1600 g离心10 min;上层淡黄色血清转移到离心管中,加入蛋...
回答于 2019-03-29 17:01
建议您将转录组数据按照有参转录组方式再重新分析一遍,然后再用作基因家族分析,如需要分析可以联系微信llcheng1314.
回答于 2019-03-27 17:34
不能。差异分析是基于整体来做的,需要用全部read count进行差异分析,若使用部分基因做分析,会破坏数据整体的特点,如测序深度、reads分布特征等,所以不推荐抽取部分来做差异分析,只能整体做完差异分析后再提取这部分基因查看表达模式。
回答于 2019-03-21 10:55
差异基因的筛选是基于统计学意义的,不能仅仅通过一个基因在两个样本中表达量数值的大小判断差异表达是否显著。差异显著情况可通过矫正后的p-value来看,矫正后的p-value越小,差异越显著。同时也可结合log2Foldchange值来判断差异的大小情况,log2Foldchange越大,差异倍数越大。
回答于 2019-03-21 10:52