169 个回答
2 赞同
0 赞同
课程里TCGA数据下载代码问题
这里面是好几个问题，我分别来回来一下： 1. GDC与TCGAbiolinks数据数量不一致： 暂时不回答，等查清楚了来回答 2. TCGAbiolinks 下载样本中癌旁和癌症样本数量少了2个： 说明这两个样本既不是癌症也不是癌旁，可能是其他类型的样本。TCGA中样品分类可以参考：https://www.omicsclass.com/question/48 文章 3. 数据下载...
回答于 2018-08-14 18:13
0 赞同
安装Aspera 时报错“This script cannot be run as root, Aspera...
出现这种问题的原因是： 安装Aspera 时采用的是root 账户， 需要采用一个普通的用户才能安装。
回答于 2018-08-10 11:56
0 赞同
0 赞同
0 赞同
0 赞同
0 赞同
0 赞同
WGCNA分析策略？10个样品，3个时期，如何进行分析？是每个时期对...
1. 建议采用30个样本一起分析，可以分析不同时期相关的聚类模块。 2. 你这10个不同的样品，没有重复，如果差异比较大的话，那可能聚类的就不太好。
回答于 2018-07-31 11:58
0 赞同
想请教一下，如果在stringtie定量后，得到的某基因有多个转录本...
GFF文件格式来看，1. FAN_iscf00000040.1 这个是染色体（参考序列），而不是基因。 2. 基因的名称应该是 “ gene_id” 后面跟着的那个属性 3. 你这个不是一个基因的三个转录本，而就是3个基因
回答于 2018-07-31 11:54