相似度更高,结果更好的。不过具体可以看一下模板序列和自己序列比对上的区域。另外PSIblast也可以调大-max_target_seqs参数看有没有比对上你想要的模板
回答于 2024-07-26 11:24
把“Intron”选项那里“intron rescale”参数改成No rescale。正常标尺就出来了。然后在AI上把正标尺改为负标尺。还不行就直接在Ai上画标尺。导出图片用SVG导出,然后另存为网页。
回答于 2024-07-26 11:05
是在上一步生成sam文件时出现问题。 命令: minimap2 -ax map-ont RNAseq.min RNA.clean.fa.gz >RNA.sam 在这一步中使用的测序结果数据RNA.clean.fa.gz是fasta格式的,错误。应该是fastq格式的才可以
回答于 2023-10-12 11:55