https://www.omicsclass.com/article/502可以参考这篇文章做。如果要学习全套的基因家族分析,可以看视频https://study.163.com/course/introduction/1209048893.htm?share=1&shareId=1031484705
回答于 2020-05-13 15:53
https://www.omicsclass.com/article/1200参考这个重新设置一下看看。完全按照这里来设置。
回答于 2020-05-12 10:56
这个暂时没有计划。因为无参的组装对硬件的要求比较高,一般的PC端电脑是无法操作的,得有专业的服务器。不过,我们后期会考虑的。
回答于 2020-05-12 08:32
参考这篇文章重新设置一下。https://www.omicsclass.com/article/260
回答于 2020-05-09 14:23
NCBI上的genebank里应该可以提取出蛋白序列以及cds序列,不过过程很繁琐麻烦,初学者操作不了的。建议找找其他数据库有没有基因组。另外,找找基因组发表的文章,可以问作者要一下基因组的文件。一般作者都会提供给你的。
回答于 2020-05-04 10:59
如果计算差异的话,不同的物种得基于同一个参考,否则没有办法做。 只计算差异的话,有重复的DEseq就可以,没有重复的EBSeq。 另外,也可以使用FPKM算一下表达量,这就是一种归一化的方式。
回答于 2020-04-10 09:05