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基因表达差异分析是使用FPKM还是用readcounts来计算显著性？
一般情况下，差异计算软件要求输入readcount 更多生物信息课程：1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参...
回答于 2019-02-22 15:42
目前说的全转录组测序是什么？
目前说的全转录组测序是基于两个文库进行测序分析的 1、lncRNA文库，也就是全RNA去除核糖体RNA之后进行链特异性文库构建，主要分析lncRNA、mRNA、环状RNA； 2、小RNA文库，主要分析microRNA 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程...
回答于 2019-02-22 15:39
低深度重测序做遗传图QTL定位于简化基因组测序做遗传图相比有什...
低深度重测序毕竟是重测序，测到的区域更全，理论上覆盖整个基因组，检测到的突变位点会更多，相应的能上图的标记就更多，做QTL定位时结果就会更加精细。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数...
回答于 2019-01-18 15:49
做完GWAS分析有必要做转录组测序进行关联验证么？
如果想发比较好的文章的话，最好针对某几个关联结果较好的性状，分不同的有代表性的材料、分不同的时间点或者处理进行取样，然后进行转录组测序，用以关联验证。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. ...
回答于 2019-01-11 16:28
细菌可以按照无参来做转录组么？
一般来说，原核细菌做转录组测序必须有基因组序列，如果没有的话可以先测一个基因组，然后再做转录组。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读...
回答于 2019-01-08 11:03
BSA分析中ED法和SNP-index的方法，哪个更加准确一些？
无亲本时，只能采用ＥＤ法，但是结果相对粗糙一些，定位的位点会很多，且区间较大，准确度不高 有亲本时，可以同时采用SNP-index和ED两种方法，但是以SNP-index为准。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读...
回答于 2018-12-23 17:39
在构建RIL群体时，父母本如何选择啊？例如是抗旱品种做母本，还...
一般是从育种的角度进行选择的，如果抗旱品种只有抗性性状较好，而不抗旱的其他性状较好，则选择抗旱品种做供体也就是父本，不抗的做受体也就是母本。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据...
回答于 2018-12-14 16:06
做BSA混池定位时，如果分不清抗感池怎么办？
这种情况，分析时只能付出双倍的工作量，随便设定一个是抗池，另一个是感池，分析一遍，然后反过来再分析一遍。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习...
回答于 2018-11-23 15:55
做WGCNA分析时，modules数量多少时结果较为理想？
这一点没有特定要求，我们可以通过树的分支是否清晰来评价结果的好坏。modules的数量是由样品本身的情况决定的。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习...
回答于 2018-11-15 20:38
构建网络是用所有表达基因还是差异基因？
这个是具体问题具体分析。如果使用所有的基因分析，会导致运算量非常大。而也不是所有的基因在这个实验中都有生物学意义，所以我们会根据具体情况做一些过滤或选取特定的基因来做。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族...
回答于 2018-11-12 08:51