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Rstudio为什么不显示菜单栏？
这个问题可能是分辨率兼容性（一般可能是因为你的显示器分辨率太高）导致的，实际菜单栏还在，但是看不到，整个软件的图形和实际位置也对不上。 我之前也遇到过，后来换了其他版本的Rstudio就好了，建议你试一下，可能是新版的Rstudio兼容性不好导致的。
回答于 2019-06-18 10:06
转录组结果中如何根据基因ID获得序列信息？
一般来说公司提供的分析结果里，都是以基因ID来指代基因的，如果想获得序列信息，要分有参还是无参的情况。 如果是有参物种，可以根据基因ID在基因组序列文件，或者CDS.fa文件里获取序列信息。 如果是无参物种，那么公司会使用软件把测序所得reads进行拼接从而获得一个unigene库，并对拼接好的基因进行命名，也就是ID，你...
回答于 2019-06-15 00:52
旧转录组数据是否还能重新分析一遍？
你好，可以的。但是需要确认几个问题（仅针对illumina测序仪）： 1. 当时公司是否给你提供了原始数据，还是仅仅提供了结题报告？一般原始数据比较大，单端测序的话，一个样品对应一个文件，双端测序的话，一个样品对应两个原始数据文件。 2. 你的数据是单端测序还是双端测序？读长是多少？ 3. 原始数据里是否已经清掉了...
回答于 2019-06-03 23:50
全转录组到底能不能测到circRNA？
说对了一部分。 全转录组其实就是对一个样品建两个文库，一个LncRNA的， 一个小RNA，LncRNA文库分析的时候就把转录组（mRNA）的顺带也分析了，也能获得部分CircRNA的信息。总共就是得到mRNA、Lncrna、小RNA和部分circrna的分析。 但是如果想专门研究CircRNA的话，还是得做那种降解线性RNA的文库，文库很贵，不包含在全转...
回答于 2019-05-23 14:47
基因家族文章里的转录组数据有什么要求
确实，现在写基因家族的文章都得把对应的表达量数据写上。 这块实验取材的时候应该结合基因家族本身的作用来选取，比较选择抗性的基因家族，比如NBS等，选取的时候就可以使用对照组和病菌处理、干旱、低温、高温等处理。如果是发育相关的，可以选择同一组织的不同发育时期的样品等。
回答于 2019-05-16 23:48
做生信的笔记本什么配置够啊？
很多同学会有这个疑问：做生物信息分析对笔记本电脑要求高吗？我的笔记本够用吗？ 贵的笔记本性能就一定强吗？ 小编发现目前网上这方面的信息很少，甚至还有些生信大V做错误的高中低配笔记本推荐，小编点进去一看“中配”的性能反而远低于廉价的“低配”，相信他也和很多人一样认为贵的，性能就好。但事实并不是这样。 本文...
回答于 2019-05-08 21:46
BSA实验到底怎么取样比较好？
这个问题其实是老生常谈了，我们先说说理想状态吧： 将每个子代样品都单独提取DNA，然后根据DNA的浓度，按等物质的量均匀混合成一份DNA，这样来自每个子代样品的DNA信息量就是等量的了，这样当然是最佳处理方式。 可实际情况是，如果你要求测序公司这么提取，他们肯定是不干的，毕竟一个BSA没多少钱，光提取100个DNA要花...
回答于 2019-04-29 14:18
如何利用自己的差异基因数据绘制kegg主注释图
“差异基因kegg注释图”是转录组分析结果的重要组成部分，能够帮助大家了解差异基因分属于哪些代谢通路，文章中如果能够插入下面这类图来说明样品间的差异，一定会为你的文章增色不少。 下面给大家介绍一下如何在Windows下对差异基因进行kegg注释。 一、输入数据准备： 首先要准备的是各比较组（比如CK1比上Treat1）的差...
回答于 2019-04-23 18:14
模式植物如拟南芥、水稻还能发基因家族文章吗？
一般来说模式生物的基因家族大部分都被研究过了，不过也不代表就不能发了。 可以将同科或同属的同一个基因家族的基因放在一起做一些基因进化选择方面的分析，这样的话，不仅能发，还能发相对更好的期刊，当然这样对你的写作能力要求更高了。
回答于 2019-04-18 19:56
想自己画venn维恩图，请教怎么画？
venn图或者叫韦恩图、维恩图，是转录组结果中的重要展示部分，能够找出各比较组之间共有和特有的基因，是最常用的转录组分析手段之一。但往往测序公司只给了几个固定组合的venn图，后期让公司补图，要加钱不说，两天给一副图的速度更是要命。 下面给大家讲一个在Windows下就能操作的，十分便捷的venn绘制方法： 一、输入...
回答于 2019-04-08 12:39