桂圆儿
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生物狗 小白狗

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用无参转录组做基因家族分析

你好,我也在考虑用无参转录组进行基因家族分析,请问你解决了吗? 我遇到的问题是想用hmmer进行分析,但是转录组没有GFF文件或者是蛋白文件,不知道怎样生成? 另外,转录组有注释可以直接利用注释进行挑选基因吗? 期待回复,谢谢

回答于 2022-07-03 17:30

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老师你好,我想问几个关于无参转录组的问题

你好,不清楚你的序列是功能基因吗?功能基因的话之后的功能分析直接用核算序列不需要蛋白序列,如果是做后续理化性质分析直接用核酸序列就可以,或者用NCBI上预测的结果进行分析

回答于 2022-07-03 17:22