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xun - 电路元件工程师

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28 个回答

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宏基因组单独组装后的contigs需要注明来源以构建基因丰度表,混...

不需要,到时候直接用salmon比对完以后直接就能获得丰度表如果确定想要知道的话也可以比对(一般来说没必要)

回答于 4天前

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宏基因组预测后使用salmon计算物种丰度的TPM值可以直接相加吗?

同一分组里的物种是可以相加的,但是跨分组比较就会失真,不是很建议

回答于 4天前

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已经windows系统里下载了docker 也打开了,但还是运行不了. doc....

是运行这个文件里面的内容,docker run 那一段,但是需要修改文件路径 就这个,然后-v是挂载,把你的数据挂进去容器,不懂的话可以看下视频,最后一个参数是镜像,可以问群里的管理老师要一下

回答于 4天前

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为啥这个. doc.sh后,显示不是内部或外部命令,也不是可运行的程...

这个最前面的点是source的别名,是shell里的命令,你需要换一个linux系统的计算机,

回答于 4天前

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清理内存后发现,docker运行不了了

你是怎么清理内存的,/home/us125/.local有被删掉吗

回答于 2024-11-14 09:24

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物种注释报错

这个是磁盘配额满了,看看能不能删掉一些没用的东西,比如之前的临时文件

回答于 2024-11-11 09:08

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我想请教一下16s高级扩增子分析中的,微生物共存网络的问题,在“...

occor.r[is.na(occor.r) | occor.p >= 0.05 | abs(occor.r) <= 0.7] = 0用这个试试

回答于 2024-10-29 09:59

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deblur生成featrue-table出现错误

关闭这个docker重新创建一个,然后加载qiime环境重新执行这个代码,

回答于 2024-10-28 10:32

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请问老师这个LDA图中的other为什莫会出现呢,如何去除,直接在图...

可以,你也可以在原始数据里删掉最后是Other 的,注释精度有的达不到种

回答于 2024-10-15 09:05

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数据质量查看遇到问题,后续,代码又试了没问题,但是好像缺了什...

额,权限看起来还是没改成功,试试这个 chmod 777 /work/my-ampliseq/tmp/qiime2 执行完以后再执行qiime 的代码 如果还是报相似的错误,就直接删除这个临时目录 rm -rf /work/my-ampliseq/tmp/qiime2

回答于 2024-10-11 09:08