老师好，我想请问一下在绘制基因家族 exon–intron structure 时如果参考基因组GFF文件里没有exon和UTR信息，只有mRNA和CDS的话怎么办呢？ - 组学大讲堂问答社区

老师好，我想请问一下在绘制基因家族 exon–intron structure 时如果参考基因组GFF文件里没有exon和UTR信息，只有mRNA和CDS的话怎么办呢？

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3 个回答

Daitoue 2019-04-01 10:15

基因家族分析的时候选择的是基因的一个代表的转录本画图的时候也可以用。前后统一对应，如果没有exon utr , 用cds 表示亦可

yige 2019-04-01 10:50

哦哦，那就提取CDS来代替了，谢谢老师啦！

安生水 2019-04-03 17:40

擅长：perl,基因家族,linux,chip-seq

注释文件没有exon , 提取cds 分析也是一样的。