这是一个经常被人混淆的两个概念；CDS是Coding sequence的缩写，是指编码一段蛋白产物的序列，是与蛋白质密码子一一对应的序列，注意其与mRNA序列的差异；ORF是open reading frame的缩写，翻译成开放阅读框，是指从一个起始密码子开始到一个终止密码子结束的一段序列，但并不是所有读码框都能表达出蛋白产物；CDS必定是一个ORF，但也可能包括多个ORF，相反，每个ORF不一定都是CDS。