如何确定ORF的长度

老师好:

        我想知道如何确定鉴定到的每一个基因的ORF长度,基因组注释文件中只有CDS的信息,而将基因序列提交到ORF Finder中,会出现多个预测的ORF结构,然后我将该基因的蛋白序列和其ORF对应的蛋白序列比对发现只有一个预测的ORF其对应的蛋白序列包括该基因的蛋白序列。那么是不是可以用该ORF长度作为该基因的长度?先谢过老师!

请先 登录 后评论

2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

可以参考这个了解一下,可能对你有帮助:https://www.omicsclass.com/article/805

请先 登录 后评论
佘本涛

老师我更新了我的问题,请您看一下

请先 登录 后评论