老师，我在基因家族鉴定时，用新生成的hmm文件做hmmsearch时，报TC bit thresholds unavailable on model domain的错误。最开始以为是e值太高1e-5,但我后面改为1e-10还是报这个错误。请问老师是什么原因呢？

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3 个回答

安生水 2019-05-10 12:58

擅长：perl,基因家族,linux,chip-seq

好像是你的hmm文件有问题，你检查一下吧。

krrrr 2021-11-24 15:04

删去 --cut_tc命令即可

omicsgene - 生物信息 2023-02-22 13:27

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

高版本的hmmsearch 会报这个错误，建议删除这个参数--cut_tc

hmmer 3.1b2 不会报错，