用circos进行基因加倍分析时,最后一步,提示如下错误。
用的config文件是培训课上config2,txt文件,chr.info截图如下:
请问哪里出问题了呢?
这是我的图的一部分
这是别人发表文章当中的图。
你的chr.info文件是有问题的,你可以参考一下这篇文章:https://www.omicsclass.com/article/644。
最后一列是按照人的染色体编号来设置染色体的颜色。
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这只是一个绘图软件,不是加倍分析软件。。。。。
根据提示应该是核型文件 里面染色体相关的错误,第三列对应的是实际的染色体,第四列是标注染色体编号,而最后一列表示的是颜色,并没有你这个格式编码对应的颜色形式,你可以修改一下看是1部分染色体无法识别(三列四列)还是2部分(最后一列)颜色格式的问题。并且,注意你后半段染色体信息种没有第五列的 0
可以参考一下:https://www.omicsclass.com/article/644