问题描述的不太明白，我猜测你是说列聚类的结果不理想，有颜色的色块不是在一起，见下图圈中区域，事实上聚类的结果是没办法改的，列聚类显示他们确实过远，如果不希望分开，可以选择不进行列聚类，固定列的顺序 结果会不一样。
另外，单纯利用原始数据画图不做转换，对应的颜色会不明显，建议是可以做数据转换的，log 或者scale处理，至于scale是基于列还是基于行 由你的数据实际意义决定，这个可以有效改变图片颜色分布，突出变化趋势。
