老师,您好我想请教一下怎样知道某个基因具体富集到哪条KEGG通路上

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Daitoue

查找该基因的注释信息,kegg中的注释理应会显示该基因于数据库中的编号,例如k01....这种的,然后去查一下对应的这个基因编号属于哪一个通路,或者会出现在哪些通路中。

注释富锦分析结果对应的文件表格会显示富集的通路包含哪些基因,你搜索一下对应的基因名称即可,可以参考参考转录组解读:转录组(有参)结果解读转录组(无参)结果解读

另外还可以自行进行基因注释,具体可以参考:转录组标准分析后的数据挖掘

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  • 沙粒和海 提出于 2019-05-30 15:04

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