发现
问答
发起
提问
文章
文章
更多
专家
讲堂
话题
财富榜
商城
Toggle navigation
首页
(current)
问答
文章
视频课程
话题
商城
搜索
登录
注册
5
老师,有没有一个课程,讲述的是热图中FPKM中的来源,,以及如何运用Linux系统讲述Reads转化为作图需要的FPKM值,以及从哪儿下载得到所需的数据呢?
fpkm
回答问题即可获得
10
经验值,回答被采纳后即可获得
10
金币。
0 条评论
分类:
转录组
请先
登录
后评论
默认排序
时间排序
1 个回答
omicsgene
- 生物信息
2019-06-08 12:40
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS
FPKM 的计算原理可以学习:
有参转录组结果解读
如果想自己从原始测序文件比对获取fpkm需要自行分析转录组:
转录组自主分析
请先
登录
后评论
×
如果觉得我的回答对您有用,请随意打赏。你的支持将鼓励我继续创作!
您需要登录后才可以回答问题,
登录
或者
注册
关注
1
关注
收藏
0
收藏,
4882
浏览
酒七
提出于 2019-06-06 19:48
相似问题
我想利用已上传的转录数据做一个数据分析,现在遇到我查找的ID和上传的转录的ID不一致,我现在该怎么才能查找到我想要的基因的FPKM数据呢?
1 回答
请问一下,FPKM的数据不需要作背景处理、四分位数校正了吗?
1 回答
一个基因,在实验组fpkm大于1,对照组fpkm小于1,有人说fpkm大于1,为有效表达,我可以把小于1的默认为等于0吗?然后做差异分析
1 回答
log2 (FPKM) 画热图
1 回答
转录组中count值为什么要经过标准化,计算FPKM值来表示表达量?
1 回答
老师好,我想问一下,RSEM、FPKM和TPM是一个什么样的关系呢?reads count又有怎样的用途,与前面三个有关系吗?有一篇paper中说,The RNA-Seq by Expectation–Maximization (RSEM) expression values were used for statistical analysis.这是说统计学分析需要用RSEM标准化处理后才能进行吗?
1 回答
×
发送私信
发给:
内容:
×
举报此文章
垃圾广告信息:
广告、推广、测试等内容
违规内容:
色情、暴力、血腥、敏感信息等内容
不友善内容:
人身攻击、挑衅辱骂、恶意行为
其他原因:
请补充说明
举报原因: