MCScanX 下游dual_synteny分析

老师，我在分析两个物种间的共线性时在下游分析时报错，报错结果见图，数据截图也给出，麻烦帮我看看，谢谢！

报错截图

gff文件

控制文件

生成的共线文件

默认排序时间排序

2 个回答

安生水 2019-07-11 17:55

擅长：perl,基因家族,linux,chip-seq

你参考下这条命令试试。

omicsgene - 生物信息 2019-08-08 15:45

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

用mcscanX做两个物种之间的共线性我没有用过，你再参考一下官网的使用说明。我看你染色体那个文件最后多余的空行删除一下试试。