5 老师,我是下载的最新版本的biolinux,但是在做不同物种之间的共线性分析比对时,最后出结果出图的时候出现这个了,请问怎么解决啊?

attachments-2019-07-bojlJgND5d2ef05407ee8.jpgattachments-2019-07-exCzKcOo5d2ef05b3a73b.jpg输入的命令为:/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.catalog ortholog ATH rapa --cscore=0.7。

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2 个回答

安生水
擅长:perl,基因家族,linux,chip-seq

首先ll检查下你的当前路径下的文件,然后检查一下ATH.cds  ATH.bed  rapa.cds   rapa.bed  这四个文件,或者截图我们帮你看一下。

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Jacob

老师,我都是用的原始的数据,在执行 /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.catalog ortholog ATH rapa --cscore=0.7 这条命令时,无法进行比对,没有生成 ATH.rapa.anchors 这个文件,导致后面的步骤无法进行;而且我是下载的最新版本的bioLINUX,麻烦老师帮忙看一下,谢谢老师。attachments-2019-07-5uUkRwnt5d3d79adec590.jpg

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  • Jacob 提出于 2019-07-17 17:58

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