WGCNA 模块特征热图意义

attachments-2019-07-LOtnJa3U5d40554c19b3b.jpg各位老师,我用WGCNA分析的芯片是有9个细胞系每个细胞系加两种处理因素,但是没有重复这种。当然也没有可关联的临床特征。如图,我这个绿色模块,根据模块向量特征热图,H处理之后,它的模块向量特征在每一个细胞系都减少。这个模块算不算有意义?可不可以认为这个模块的基因与H因素处理关系密切。

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1 个回答

Daitoue

上图只是显示一下该模块内基因的表达数据情况,如果想知道模块和某个处理(形状)是否关系密切 建议看相关性热图,计算模块和性状之间的相关性 p值等。

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