这种情况需要注意取样时,将土与根分开取样,不要相互污染。
有一篇发表在PNAS上文章做的是水稻根际土、根围土以及根内生菌的微生物多样性,里面对不同样品的取材做了详细的描述,参考文献:
Edwards J, Johnson C, Santos-Medellín C, et al. Structure, variation, and assembly of the root-associated microbiomes of rice[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2015, 112(8): E911-E920.