在取样上没有太多区别。同一份样品送到测序公司，测序公司提取出微生物DNA之后，测真菌多样性和细菌多样性用的扩增引物不一样；一般主流的方法，对真菌的ITS进行扩增获得其序列，测细菌的话，对V3+V4区进行扩增。
也就是说取样方式一样，指定公司去测真菌或者细菌就可以了。
