GO层级整理

老师,请教一下,要怎么将GO terms 的层级信息整理出来,类似这样

attachments-2019-09-HgRaSaJf5d90132b8bb46.png待整理表格如下

attachments-2019-09-fUhIBOWg5d90133a230f2.png


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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

GO层次关系存在这一个obo的文件里面,直接下载就好:http://geneontology.org/docs/download-ontology/

如果需要整理的话,需要自行编写perl或者python脚本才能完成,

perl入门到精通perl语言高级  

python: https://www.omicsclass.com/article/1031

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