我在构建进化树的时候，分类依据是拟南芥的分类和进化树本身的特点，但发现有的成员分类错误，采用ML法，校正参数Bootstrap设置为1 000次重复，结果出来后却发现，AtLC10本应该在第二组，AtLC13应该在第三组，但实际的结果恰恰相反，之后我又换了NJ法，结果还是不理想，依然有成员分组混乱，不知道我是哪里做的不对，希望得到指导。（AtLC10:AT5G01190.1,AtLC13:AT5G07130.1） - 组学大讲堂问答社区

我在构建进化树的时候，分类依据是拟南芥的分类和进化树本身的特点，但发现有的成员分类错误，采用ML法，校正参数Bootstrap设置为1 000次重复，结果出来后却发现，AtLC10本应该在第二组，AtLC13应该在第三组，但实际的结果恰恰相反，之后我又换了NJ法，结果还是不理想，依然有成员分组混乱，不知道我是哪里做的不对，希望得到指导。（AtLC10:AT5G01190.1,AtLC13:AT5G07130.1）

1 条评论
分类：基因家族分析

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1 个回答

omicsgene - 生物信息 2019-11-28 22:33

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

分组这个需要调整，你再琢磨琢磨。看看基因序列特点。

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辣味牛奶提出于 2019-11-28 08:12