老师，您好，我是在做有参转录组分析。在对基因组构建HISAT index时，所产生的splicesites.tsv，exons.tsv文件大小为0，但是并没有报错，请问这是什么原因呀，命令如下 - 组学大讲堂问答社区

老师，您好，我是在做有参转录组分析。在对基因组构建HISAT index时，所产生的splicesites.tsv，exons.tsv文件大小为0，但是并没有报错，请问这是什么原因呀，命令如下

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分类：转录组

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1 个回答

omicsgene - 生物信息 2019-12-03 16:08

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

怀疑GTF格式有问题：

检查你的GTF与课程里面的GTF格式上有啥区别，对应修改一下；

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scau_bioinfo 提出于 2019-12-03 10:42